A község neve írott forrásban először 1193-ban fordul elő, Neeg, Gnec alakban. Ez az egyszerű névalak a későbbi századokban is előfordul, de a 14. század végétől egyre gyakrabban valamelyik megkülönböztető előtagjával együtt használják (közel volt hozzá a másik Fejér megyei Nyék). Nyék néven említik 1457-ben és 1617-ben. 1395-ben Fertőfőnyéki 1515-ben Nyék vagy Kápolnás Nyék, 1516-ban Nyék, más néven Fertőfő Nyék, 1562-ben Fertő vagy Kápolnás Nyék, 1593-ban Kápolnás Nyék, 1630-ban Kápolnás Nyék vagy Fertőfő Nyék, ugyanebben az évben Fertőfő és (!) Kápolnás Nyék, 1696-ban Fertőfő vagy Kápolnás Nyék. 1667-ben, 1672-ben és 1760-ban a minden bizonnyal félreértésből származó Fertőfenék néven bukkan elő. Ezt Fényes Elek is átvette, Károly János pedig sajátságos logikájú magyarázatot fűzött hozzá. Valószínűleg névtorzulás eredménye az 1632-ben előforduló Káposztás Nyék, ugyanis ezen a néven a községet sehol másutt nem említik. A település két részét a 18. századtól kezdik megkülönböztetni: 1798-ban Alsónyéket, 1810-ben Alsó Kápolnásnyéket, 1826-ban Kápolnás Alsó Nyéket, a múlt század derekán (Kápolnás Alsó és Felső) Nyéket találunk a forrásokban.
A név a Nyék törzsnévből keletkezett, ami arra enged következtetni, hogy a honfoglalás korában a Nyék törzs egy szórványa szállta meg. Magának a Nyék törzsnévnek az ómagyar „nyék" (=kerítés, sövény) volt az előzménye. A Kápolnás megkülönböztető előtag a község területén egykor létezett kápolnára utal. A Fertőfő bizonyára onnan ered, hogy a község a más sekély tavak mintájára régen Fertőnek nevezett Velencei-tó felső végénél („fejénél") fekszik.
